Dybbøl Mølle er opført i 1744. I 1800 slog lynet ned i møllen, der nedbrændte. Den genopførtes dog straks derefter. I begge slesvigske krige 1848-50 og 1864 blev den ødelagt og genopført. Efter 1864 og danskernes nederlag til prøjserne, blev møllen et sindbillede på dansk udholdenhed i det tabte land. I 1935 nedbrændte møllen efter en kortslutning, men genopførtes i dens nuværende form. Indtil 1990 blev møllen drevet af en række forpagtere. I 1995 indrettede Museet på Sønderborg Slot udstillinger i kornmagasinet og møllen.